淳佑九年（1249年），門下、尚書、中書三省共同議事，奏請取旨，奉旨行下，宋慈除直煥章閣，知廣州，主管廣東經略安撫司公事。宋慈由湖南提刑升任廣東路的最高行政長官。

按官職的任命規矩，安撫使必須由太中大夫以上或曾任侍從官者兼任，官員品級低者只稱“主管某路安撫司公事”或“管勾安撫司事”。宋慈品級不夠，只能稱“主管廣東經略安撫司公事”。這也體現了朝廷的器重，破格錄用。

廣州安撫使一職，除了兵民之政，還要處理邊境貿易等與番國交往的外交事務。

到廣州不久，宋慈就生病了，墓志中說是“末疾”，這是一種四肢疲軟的疾病。其實“末疾”已暗示身體出了問題，但宋慈所有的事都親力親為。

為了尊重教化，敦化人倫，宋慈決定在學宮舉行隆重的釋菜禮。釋菜禮是用水芹、水藻之類的“菜”來祭祀孔子祭祀先賢以表達師道人倫的一種儀式。

祭祀先師有釋菜禮和釋奠禮兩種方式。在宋朝，釋菜禮與釋奠禮的概念有些混淆。唐朝的歐陽修在《襄州榖城縣夫子廟記》就說，古代士人拜見老師，以菜為禮物，所以剛入學的士人一定要通過釋菜來向老師表達禮儀。學官在四時祭祀圣人則就用釋奠禮了。但在宋朝，釋菜禮和釋奠禮基本是同一指向。紹熙五年（1194）十二月，宋慈八歲的時候，朱熹將建陽考亭的竹林精舍改建成滄洲精舍，他就帶領各位門生舉行釋菜禮，當時，朱熹還寫了祝文：“恭惟道統，遠自羲軒。集厥大成，允屬元圣……周程授受，萬理一原。”

在廣州釋菜禮的儀式上，宋慈按照規矩擔任主祭，工作強度相當的大。

主祭要跪拜幾十次，要取水芹、水藻這些菜，還要洗菜，要將菜擺在圣人席前，要進退，要升降，要向眾人獻禮，要敬酒，從凌晨起床要忙到傍晚，史書上記載，這類禮儀“強有力者猶不勝”。即使強有力的人都難以承受。宋慈本來就患有四肢疲軟的疾病，身體一直不好，釋菜禮后，更是每況愈下，三月九日去世于廣州任上。

去世后，李昴英為宋慈撰寫他一生的簡歷——《行狀》。一年后，宋慈歸葬建陽雒田里的昌茂坊。十年之后，宋慈的好友劉克莊為宋慈寫下《宋經略墓志銘》。

宋慈是個清正的人，有一次，他的干人（相當于私人的助理）被懷疑違法，而宋慈是提刑官，當時的州府拿不定主意不知如何是好，宋慈說：“自出衙門，即非干人，既下獄司，便是罪人，或訊或繃，一聽獄官之便，千萬不必回護。”

宋慈說，雖然是我的私人助理，但出了衙門，就不是了，如果到了司法程序，就是罪人了，是訊問還是捆綁，交由獄官處理，千萬不要因為我而袒護。

劉克莊在《宋經略墓志銘》里記錄了一句這樣的話：

（宋慈）每誦諸葛武侯之言，曰：“治世以大德，不以小惠。”其趣向如此。性無他嗜，惟喜收異書名帖，祿萬石，位方伯，家無釵澤，廄無駔駿，魚羹飯，敝缊袍，蕭然終身。晚尤謙挹，扁其室曰“自牧”。

宋慈常常誦讀諸葛武侯的文字，說：“治世以大德，不以小惠。”他的興趣志向就像這樣。生性沒有其它嗜好，只是喜歡收集一些書帖，俸祿達萬石，官位至方伯（地方長官），但家中沒有珍貴的首飾，棚中沒有健壯的馬匹，魚湯拌的飯，亂麻絮的袍，一生蕭條。惠父晚年尤其謙遜禮讓，為自己的居室題匾“自牧”。

《易經》中，有一個卦，叫謙卦，其中一句話是“謙謙君子，卑以自牧”，是指一個君子，要常常用謙卑的姿態來培養自己的品德。宋慈是想用謙卑來修養道德。宋慈是一個低調清廉守正的官員。

劉克莊在《宋經略墓志銘》的最后，留下一句：“嗟后之人，勿傷其宰（墳墓）上之木也”。是希望后人，在宋慈的墓地，不要去砍伐林木，破壞墓地。宋慈為官，清廉守正，以民為本，考慮百姓的多，考慮自己的少，又能不畏強暴，不循私情，仕宦辛勞，死而后已。宋慈為人為官，都值得后人學習。如今，政府重修宋慈陵園，百姓追懷宋慈精神，墓地的林木蓊郁，四圍清幽，人們依然沒有忘記這位好官。(祝熹)